Ao no Exorcist narra una historia ambientada en dos mundos: el de los humanos, Assiah, y el de los demonios, Gehenna. Los demonios solo pueden entrar en Assiah poseyendo a un humano. Esto la ocurrió a una joven (Yuri Egin), que tras ser poseida la dejó embarazada. Pero esta información llega a oidos del cardenal Ernst Egin y es mandada a la hogera. El demonio intenta poseer a alguno de los presentes para salvarla, pero ningún humano soporta su presencia y van muriendo, excepto Shiro Fujimoto, al que posee y salva a la muchacha. Esa noche es llamada la noche azul. Una vez da a luz a sus hijos Rin y Yukio, estos son puestos a cargo de Shiro, que les cría. Unos 16 años después, Rin manifiesta sus poderes demoníacos, Shiro y los demás intentan protegerle, y desafortunadamente muere poseido por un demonio que intenta llevarse a Rin a Gehenna. Posteriormente este es Rin trasladado a la academia Vera Cruz para convertirse en exorcista, junto a su hermano que trabaja allí. A partir de este momento Rin luchará para controlar sus poderes y convertirse en un exorcista.