Kiznaiver tiene lugar en una ciudad ficticia, llamada Ciudad Sugomori. En esta ciudad se investiga sobre un nuevo sistema "Kizuna" que quieren implementar para lograr la paz mundial a través de la conexión de las personas mediante sus heridas. A los sujetos conectados entre si se les denomina Kiznaivers. Cuando uno sufre física o psicológicamente este dolor se transmite entre todos los conectados. Un buen día Sonozaki, una compañera de clase de nuestro protagonista llamado Katsuhira, le comunica que ha sido elegido para formar parte del sistema Kizuna y probar sus efectos sobre él y varios de sus compañeros.

La trama en un principio parece interesante, en el fondo el anime está entretenido, pero ciertos matices en su desarrollo como la voz que siempre está guiando a los Kiznaivers al puro estilo de Dangaronpa cansa bastante y bajo mi punto de vista estropea toda la historia.