Zetsuen no Tempest comienza con dos amigos, Takigawa Yoshino y Fuwa Mahiro. Hace un año que la hermana de Mahiro fue asesinada en su casa, y su hermano se fija como objetivo único encontrar al asesino de su hermana y vengarse. Un día estando Yoshino frente a la tumba de la hermana de Mahiro, tiene un encontronazo con una mujer que se hace llamar Evangeline, que está investigando a su amigo Mahiro por sucesos extraños que ocurrían en los lugares por donde viajaba. Resulta que este se ha asociado con cierta chica la cual está encerrada en una isla, a la cual esta ayudando a cambio de que ella descubra al asesino de su hermana Fuwa Aika. Yoshino se verá envuelto junto a Mahiro en una serie de sucesos a la vez que buscan pistas para encontrar al asesino.

Atención: Subtítulos español latino, poco neutros. Avisados estáis, hay frases que sacan de quicio (si eres de España).