Assassination Classroom S2, que es la segunda temporada de Ansatsu Kyoushitsu, continúa la historia de Nagisa Shiota y su clase 3-E, la clase de los malos estudiantes que tienen el objetivo de matar a su profesor, el monstruo Koro-sensei que destruyó parte de la Luna y amenaza con destruir la totalidad de la Tierra con sus características sobrehumanas si no le asesinas antes de que termine el curso. Recordemos que terminaron de una manera un poco abrupta sus vacaciones de verano, no logrando su objetivo de asesinar a su profesor, y poniendo a toda la clase en riesgo por la estrategia de un tercero. También habrá una nueva incorporación en la clase, nuevos intentos de matarlo... ¿Lo conseguirán?